吉林中医药

2019, v.39(12) 1638-1641

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基于GEO数据库对脑梗死相关差异基因的分析研究
Analysis of Differentially Expressed Genes Related to Cerebral Infarction Based on GEO Database

杨正飞;杨小燕;郭茂娟;徐彦龙;姜希娟;

摘要(Abstract):

目的比较模型组(MCAO组)大鼠与假手术组(Sham组)大鼠脑组织的差异基因,分析差异基因影响的功能通路,为脑梗死的治疗提供可行的研究方向和具体的作用靶点。方法在GEO数据库下载MCAO组大鼠与Sham组大鼠脑组织中的表达谱芯片,并通过R软件得到差异基因;利用DAVID 6.8分析差异基因的GO功能富集和KEGG通路富集。结果通过分析得到148个差异表达基因,123条GO富集通路,主要涉及药物反应、脂多糖反应、炎症反应、有机环状化合物反应及细胞外基质等生物过程,并与蛋白结合、受体结合、蛋白质同源化活性、整合素结合、蛋白酶结合及趋化因子的活性等分子功能相关;KEGG通路富集分析,得到显著性富集通路23条,涉及TNF信号通路、NF-κB信号通路、Toll样受体信号通路和HIF-1信号通路等。结论 TNF信号通路与NF-κB信号通路可能是治疗脑梗死的行之有效的干预方向。

关键词(KeyWords): GEO数据库;脑梗死;差异基因;富集分析;基因芯片

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金(81561502);; 天津中医药大学中西医结合学院2017年度研究生创新基金(CXJJLX201709)

作者(Authors): 杨正飞;杨小燕;郭茂娟;徐彦龙;姜希娟;

DOI: 10.13463/j.cnki.jlzyy.2019.12.028

参考文献(References):

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