基于COI序列的蛤壳及其混伪品的DNA分子鉴定
杜鹤;崔丽娜;孙佳明;张辉;
摘要(Abstract)：
目的:利用COI序列对蛤壳及其混为品进行DNA分子鉴定。方法:对蛤壳及其混为品的11份样品的COI序列进行研究,分析其种内及种间遗传距离,并构建珍珠母及其混伪品的NJ树。结果:蛤壳种内COI序列变异很小比较稳定。文蛤、青蛤与其主要混伪品COI序列间存在较多的变异位点,种间的遗传距离显著大于种内的遗传距离。同时,从基于COI序列构建的蛤壳及其混伪品NJ树可以看出,蛤壳不同来源个体均聚在一起,与其它混伪品能够很明显区分开。结论:基于COI序列的DNA条形码技术可以很好的鉴定蛤壳及其混伪品,为该药材的准确鉴定提供可靠,有效的新方法。
关键词(KeyWords)： 蛤壳;DNA条形码;COI鉴定
基金项目(Foundation):
作者(Author): 杜鹤;崔丽娜;孙佳明;张辉;
Email:
参考文献(References)：
- [1]国家药典委员会.中国药典(一部)[S].北京:化学工业出版社,2010:147.
- [2]Schindel DE,Miller SE.DNA barcoding,a useful tool for tax-onomists[J].Nature,2005,435:17.
- [3]陈士林,宋经元,姚辉,等.药用植物DNA条形码鉴定策略及关键技术分析[J].中国天然药物,2009,7(5):322-327.
- [4]陈士林,姚辉,宋经元,等.基于DNA barcoding(条形码)技术的中药材鉴定[J].世界科学技术—中医药现代化,2007,9(3):7-12.
- [5]Hebert PD,Cywinska A,Ball SL,et al.Biological identifi-cationsthrough DNA barcodes[J].Proc Biol Sci,2003,270(1512):313-321.
- [6]Hebert PD,StoeckleM Y,Zemlak T S,et al.Identificati on of birdsthrough DNA barcodes[J].Plos B iol,2004,2(10):1657-1663.
- [7]Giribet G.,Wheeler W.C.On bivalve phylogeny:a high-levelanalysis of the Bivalvia(Mollusca)based on combined morphologyand DNA sequence data.Invertebr[J].Biol.,2002,121(4):271-324.
- [8]Machordom,A.,Araujo,R.,Erpenbeck,D.,et al.Phylogeogra-phy and conservation genetics of endangered European Margari-tiferidae(Bivalvia:Unionoidea)[J].Biol.J.Linn.Soc.Lond.,2003,78:235-252.
- [9]Feng Y,Li Q,Kong L,et al.DNA barcoding and phylogeneticanalysis of Pectinidae(Mollusca:Bivalvia)based on mitochondrialCOI and 16S rRNA genes[J].Mol.Biol.Rep.,2011,38(1):291-299.
- [10]徐巧情,刘俊.三角帆蚌不同组织基因组DNA提取效果比较[J].水生态学杂志,2010,3(2):121-124.
- [11]Folmer O,Black M,Hoeh W,et al.DNA primers for amplifica-tion of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I from diversemetazoan invertebrate[J].Mol Mar Biol Biotechnol,1994(3):294-299.